1. 実験で用いた遺伝子組換えジャガイモは、その系統が対照実験で用いた非組換えジャガイモとかなり異なるものを使用しているため、実験の精度が低い。
   
   
2. 遺伝子組換えジャガイモを与えたラットと与えないラットで臓器重量の違いがあったとの報告があったが、このデータは特定の臓器でしか行われていない。また、臓器そのものの湿重量のみを計測しており、ラットの体重あたりの臓器重量の変化を示していない。
   
   
3. レクチン遺伝子を組み込んだジャガイモを与えたラットとレクチンそのものを与えたラットを比較した場合、両ラットの成長に有意差は見られなかった。
   
   
4. 免疫系については、十分な検査が行われておらず、生物学的な有意差を断定できない。

以上の点から、実験は予備的なものであり、科学的に十分な結論は得にくいと考えられている3）。

　A. Pusztaiの報告は1999年2月に発表されたが、科学性に問題があるとして、専門誌に掲載されなかった。しかし、1999年10月、医学専門誌の「The Lancet」は、A. Pusztaiの昆虫、線虫類に抵抗性を示すレクチン遺伝子組換えジャガイモを用いて行った実験に関する報告を、実験の設計や分析について不十分な点が多いという前提で掲載している4)、5)、6）。
　この実験では、遺伝子組換えジャガイモと非組換えジャガイモ、及び非組換えジャガイモに導入した遺伝子が産生するマツユキソウのレクチンを添加した餌を、それぞれ生、及びゆでたジャガイモを材料にして調製し、この6種類の餌をラットに10日間与えた時の影響を比較している。ここでは、遺伝子組換えジャガイモの餌によりラットの一部の臓器や免疫系への影響が指摘されているが、この影響がタンパク質不足の餌によるストレスや、ジャガイモの品種や餌の低消化性によるとも考えられ、このような結論は出せないとのコメントも掲載されている7）。